Bayern München, officieel bekend als Fußball-Club Bayern München e. V., werd op 27 februari 1900 opgericht door een groep van elf gepassioneerde voetballers onder leiding van Franz John (FC Bayern München). De club werd opgericht vanwege een meningsverschil met de Münchner Sport-Club (MSC), waar de voetballers vonden dat ze niet genoeg focus en aandacht kregen.
In de beginjaren stond Bayern München voor verschillende uitdagingen. Het team begon in lokale competities voordat het doorgroeide naar de hoogste voetbalcompetitie in Duitsland. Hun eerste opmerkelijke succes kwam in 1932 toen ze hun eerste Duitse kampioenschap wonnen (Bundesliga).
Gedurende hun vroege jaren hebben enkele belangrijke spelers bijgedragen aan het vormgeven van de geschiedenis van de club. Josef "Pipinsried" Pöttinger was een van die legendes die tijdens het seizoen maar liefst 34 doelpunten scoorde, wat hen hielp hun eerste Duitse titeloverwinning in 1932 veilig te stellen.